会议围绕“实现‘大三通’以后两岸经贸关系发展的新趋势”、“具有两岸特色的经济合作机制探讨”、“两岸经济共同发展同亚太经济合作机制相衔接的途径”、“全球金融危机形势下两岸经济与金融合作的新主题”等四个专题展开。主要观点包括:
第一，两岸经贸合作必须放到国际背景下去考虑，从世界经济的视野去思考、去规划。这样的思考从短期来看是为了应对当前这场经济危机，从长期来看是从经济全球化的高度探讨两岸经济合作的方式，从而提升两岸经济的国际竞争力，提升中华民族的国际地位。
第二，企业在两岸经贸合作中的作用十分重要。从台湾来说，在某些产业领域已经在全球生产体系中形成了核心竞争力，如集成电路和平板显示产业，应进一步推动两岸在这两个领域的交流与合作。此外，两岸的企业要在全球竞争体系中取得优势，共同培育自己的民族品牌、加强知识产权保护也是非常重要的一个方面。
第三，目前两岸经贸关系已经进入了制度化、全球化、区域化、一体化和本地化的阶段，不仅要走出新的特点，还要建立新的平台和新的机制，从单向向双向，从浅层次向深层次发展。
第四，两岸经贸合作未来的重点在于产业合作。要落实这一合作一定要靠产业界，只有这样才能达到双赢的目的。
第五，两岸的经贸合作与交流不仅有学者层面的，还有智库之间的以及具体政府部门之间的。互信是两岸合作的重要基础。
第六，未来在东亚地区最稀缺的资源是市场，谁能够拥有足够的市场，谁就能在未来的东亚居于核心地位，所以海峡两岸经贸合作的空间非常大。
第七，两岸在能源、旅游等领域存在着大规模合作的条件。同时，在长三角地区，两岸合作绝不可能长期局限于低端产业，必然要转型升级，这是非常重要的。
第八，两岸金融合作与交流要解决的第一个问题是加快两岸金融市场的整合，包括中小企业的融资业务合作，农村金融合作，中间业务和金融创新的合作，还有离岸金融方面的合作等。
